הומאופתיה קלאסית היא שיטת ריפוי הוליסטית המתייחסת לכל רבדיו של האדם. ככזו, היא מציעה למטופל רמדי אחת, שמותאמת לו באופן אינדיבידואלי, על סמך אבחון יסודי ומעמיק של מצבו הפיזי, המנטאלי והנפשי. הנחת המוצא היא, שרק על ידי הבנת מקור המחלה ואופן התפתחותה, ניתן לטפל בה מהשורש ולמנוע את חזרתה. הרמדי הנבחרת מאזנת את הרגישות הפנימית הקיימת באדם, בכך היא מסייעת לו להתגבר על תלונתו הנוכחית ומחזקת אותו לקראת התמודדויות עם גורמי מחלה נוספים בעתיד. זו למעשה שיטת הריפוי המקורית, כפי שפותחה על ידי ד"ר סמואל הנמאן לפני יותר מ- 200 שנה.
לעומתה, ההומאופתיה המודרנית היא שיטה צעירה יחסית, אשר מציעה טיפול סימפטומטי בלבד. בשיטה זו אין שום בירור לגביי האפיונים של התלונה או ניסיון להבין מדוע וכיצד היא התפתחה. מה שבכל זאת יש, אלו תכשירים מוכנים מראש (מוצרי מדף), המתקבלים מערבוב של כמה רמדי'ס, שלהן זיקה כללית לסימפטום בו התכשיר נועד לטפל (למשל כאב ראש). גישה זו היא שטחית מטבעה, במקרה הטוב היא עשויה להביא להיעלמות זמנית של הסימפטום ובמקרה הרע היא עלולה לגרום לנזק.
הטיפול בשיטה המודרנית יקר יותר מאשר בזו הקלאסית, זאת כיוון שיש בה צורך בשימוש יומיומי בכמות רבה של תכשירים, שמחירם גבוה יחסית. (מחירה של רמדי קלאסית נע בין 30-70 ש"ח).